Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AP3B2Q13367 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP3B2Q13367 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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