Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATMQ13315 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATMQ13315 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATMQ13315 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATMQ13315 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATMQ13315 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATMQ13315 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATMQ13315 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATMQ13315 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATMQ13315 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATMQ13315 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATMQ13315 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATMQ13315 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATMQ13315 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATMQ13315 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATMQ13315 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATMQ13315 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATMQ13315 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATMQ13315 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATMQ13315 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATMQ13315 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATMQ13315 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATMQ13315 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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