Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK3Q13003 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK3Q13003 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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