Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXC1Q12948 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXC1Q12948 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms