Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMAN2Q12907 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMAN2Q12907 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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