Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SREBF2Q12772 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SREBF2Q12772 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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