Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCAPQ12770 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCAPQ12770 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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