Protein–RNA interactions for Protein: Q12749

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, yeastyeast

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC6Q12749 CMD1YBR109C 444 nt3.45□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 CTP1YBR291C 900 nt3.45□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 UBP5YER144C 2418 nt3.45□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 VPS33YLR396C 2076 nt3.45□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 TAF2YCR042C 4224 nt3.45□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 EMP70YLR083C 2004 nt3.44□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.44□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 AIM11YER093C-A 414 nt3.44□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 HTD2YHR067W 843 nt3.44□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 RPS28BYLR264W 204 nt3.44□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 SAM37YMR060C 984 nt3.44□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 AAR2YBL074C 1068 nt3.44□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 IRC13YOR235W 315 nt3.44□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 IRC3YDR332W 2070 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 APC5YOR249C 2058 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 CHO2YGR157W 2610 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 BI3Q0115 1554 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 DOA4YDR069C 2781 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 PET100YDR079W 336 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 RGI1YER067W 486 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YGL177WYGL177W 348 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 BOS1YLR078C 735 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YLR400WYLR400W 474 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YMR141CYMR141C 309 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 SSN8YNL025C 972 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 PEX15YOL044W 1152 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YBR013CYBR013C 390 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 GRX7YBR014C 612 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 XRN1YGL173C 4587 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 PFK26YIL107C 2484 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 FAR1YJL157C 2493 nt3.43□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 DSE1YER124C 1722 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YDL180WYDL180W 1644 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YPS6YIR039C 1614 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YCR016WYCR016W 873 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 UBC9YDL064W 474 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 TEM1YML064C 738 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 CSM3YMR048W 954 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YNL109WYNL109W 546 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 PFY1YOR122C 381 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YOR203WYOR203W 354 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 UBS1YBR165W 834 nt3.42□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 TCP1YDR212W 1680 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 GIC2YDR309C 1152 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YGR107WYGR107W 450 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 RPA12YJR063W 378 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 PHD1YKL043W 1101 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 NNT1YLR285W 786 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 RPN13YLR421C 471 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 YML094C-AYML094C-A 402 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 MTG1YMR097C 1104 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 FMP41YNL168C 780 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 STT4YLR305C 5703 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 GYL1YMR192W 2163 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 RED1YLR263W 2484 nt3.41□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 BEM4YPL161C 1902 nt3.4□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 SSE2YBR169C 2082 nt3.4□□□□□ -1.86
SMC6Q12749 APA2YDR530C 978 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 DOG2YHR043C 741 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 RPC37YKR025W 849 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 ENV10YLR065C 546 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 APC9YLR102C 798 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 ATG19YOL082W 1248 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 YOL114CYOL114C 609 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 PSP1YDR505C 2526 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 PEX6YNL329C 3093 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 GCD2YGR083C 1956 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 TFC1YBR123C 1950 nt3.4□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 CDH1YGL003C 1701 nt3.39□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 snR68snR68 136 nt3.39□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 CDC5YMR001C 2118 nt3.39□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 YMR099CYMR099C 894 nt3.39□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 YBL065WYBL065W 345 nt3.39□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.39□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.39□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.39□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 AI4Q0065 1671 nt3.39□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 YCG1YDR325W 3108 nt3.39□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 TPO5YKL174C 1857 nt3.39□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 YER138W-AYER138W-A 105 nt3.38□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 UPF3YGR072W 1164 nt3.38□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 PSF2YJL072C 642 nt3.38□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 YLL037WYLL037W 381 nt3.38□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 RPL15AYLR029C 615 nt3.38□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.38□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt3.38□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 TIM12YBR091C 330 nt3.38□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 DSF2YBR007C 2211 nt3.38□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 SRP68YPL243W 1800 nt3.37□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 PAM1YDR251W 2493 nt3.37□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 EPL1YFL024C 2499 nt3.37□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 MNT3YIL014W 1893 nt3.37□□□□□ -1.87
SMC6Q12749 SPP382YLR424W 2127 nt3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.4 ms