Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 ELP2YGR200C 2367 nt4.68□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 STE7YDL159W 1548 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 ALE1YOR175C 1860 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 PRR1YKL116C 1557 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YML096WYML096W 1578 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 RPL28YGL103W 450 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 RMR1YGL250W 726 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 EGD2YHR193C 525 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 BLI1YKL061W 342 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YOL160WYOL160W 342 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 RTS1YOR014W 2274 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 NTH2YBR001C 2343 nt4.67□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 RPN3YER021W 1572 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 CYK3YDL117W 2658 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 ATP8Q0080 147 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 NTF2YER009W 378 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 VAM7YGL212W 951 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YGR022CYGR022C 330 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 Q0143Q0143 153 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YGR190CYGR190C 366 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 MTM1YGR257C 1101 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 GOS1YHL031C 672 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 PIR1YKL164C 1026 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YNL184CYNL184C 327 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 PPG1YNR032W 1107 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YOR121CYOR121C 306 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 MAG2YLR427W 2013 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 FUS2YMR232W 2034 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 KIN3YAR018C 1308 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 DBF2YGR092W 1719 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 RIM4YHL024W 2142 nt4.66□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 ARX1YDR101C 1782 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 VAN1YML115C 1608 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 HXT14YNL318C 1623 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 SWC4YGR002C 1431 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 DAL81YIR023W 2913 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 CDC14YFR028C 1656 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 RSC6YCR052W 1452 nt4.65□□□□□ -1.66
TY1A-NL1Q12391 YPT53YNL093W 663 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 NRM1YNR009W 750 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 ENV9YOR246C 993 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YBR032WYBR032W 303 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 RPS11BYBR048W 471 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 GAS3YMR215W 1575 nt4.65□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 EXO1YOR033C 2109 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 TOG1YER184C 2385 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 SEC27YGL137W 2670 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 TDA11YHR159W 1515 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YCR050CYCR050C 309 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 HOM2YDR158W 1098 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YJR038CYJR038C 363 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 TDA5YLR426W 981 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YLR434CYLR434C 384 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 CBC2YPL178W 627 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 AEP3YPL005W 1821 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 GAL10YBR019C 2100 nt4.64□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 CDC6YJL194W 1542 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 MCX1YBR227C 1563 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YDR355CYDR355C 303 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 NAG1YGR031C-A 492 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 RPS1BYML063W 768 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 NOP15YNL110C 663 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YOR331CYOR331C 558 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YPL107WYPL107W 747 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YPR096CYPR096C 303 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 FYV5YCL058C 459 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 HRD1YOL013C 1656 nt4.63□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 SEC2YNL272C 2280 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 ADE4YMR300C 1533 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 CHA4YLR098C 1947 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 AVT3YKL146W 2079 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 PRP11YDL043C 801 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 RMT2YDR465C 1239 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YIL024CYIL024C 570 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 ERG3YLR056W 1098 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 POL4YCR014C 1749 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 TPO5YKL174C 1857 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 SOG2YOR353C 2376 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 LST4YKL176C 2487 nt4.62□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 NNF1YJR112W 606 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 MRPL20YKR085C 588 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 VPS63YLR261C 327 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YLR269CYLR269C 351 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 DAL82YNL314W 768 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YGK3YOL128C 1128 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 MET31YPL038W 534 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YPL276WYPL276W 438 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YPR039WYPR039W 336 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 PIN3YPR154W 648 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 QCR2YPR191W 1107 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 SHG1YBR258C 429 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 TPS3YMR261C 3165 nt4.61□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YNR063WYNR063W 1824 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 GDB1YPR184W 4611 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 CNL1YDR357C 369 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 YDR431WYDR431W 312 nt4.6□□□□□ -1.67
TY1A-NL1Q12391 AUA1YFL010W-A 285 nt4.6□□□□□ -1.67
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