Protein–RNA interactions for Protein: Q12000

TMA46, Translation machinery-associated protein 46, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA46Q12000 ARO2YGL148W 1131 nt4.57□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 GPP1YIL053W 753 nt4.57□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YML031C-AYML031C-A 336 nt4.57□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 snR41snR41 95 nt4.57□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YER158CYER158C 1722 nt4.57□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 MSE1YOL033W 1611 nt4.57□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YER077CYER077C 2067 nt4.57□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 AZR1YGR224W 1842 nt4.56□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 GAL80YML051W 1308 nt4.56□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 TRM11YOL124C 1302 nt4.56□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 BNA7YDR428C 786 nt4.56□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 SLD5YDR489W 885 nt4.56□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 COX2Q0250 756 nt4.56□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 EMC2YJR088C 879 nt4.56□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YML053CYML053C 639 nt4.56□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 GRE2YOL151W 1029 nt4.56□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 THI20YOL055C 1656 nt4.56□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 TIF4632YGL049C 2745 nt4.56□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YDR115WYDR115W 318 nt4.55□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 RIP1YEL024W 648 nt4.55□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YER046W-AYER046W-A 330 nt4.55□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YER119C-AYER119C-A 372 nt4.55□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.55□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YPL107WYPL107W 747 nt4.55□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 SSO1YPL232W 873 nt4.55□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 SPN1YPR133C 1233 nt4.55□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 SEC66YBR171W 621 nt4.55□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 ALO1YML086C 1581 nt4.55□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 PRP28YDR243C 1767 nt4.55□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 TGL4YKR089C 2733 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 ARG82YDR173C 1068 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 SNA2YDR525W-A 240 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 IES5YER092W 378 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 ACF4YJR083C 930 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 ENT3YJR125C 1227 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 RPS4AYJR145C 786 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 CSE4YKL049C 690 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 FBP1YLR377C 1047 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 RPL15BYMR121C 615 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 PBI2YNL015W 228 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 ASI2YNL159C 870 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 HUB1YNR032C-A 222 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 DER1YBR201W 636 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 GRC3YLL035W 1899 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt4.54□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 SAP4YGL229C 2457 nt4.53□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt4.53□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 HUR1YGL168W 333 nt4.53□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 VPS63YLR261C 327 nt4.53□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 NNT1YLR285W 786 nt4.53□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 YLR297WYLR297W 390 nt4.53□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 GPI15YNL038W 690 nt4.53□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 TPK2YPL203W 1143 nt4.53□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 RSC3YDR303C 2658 nt4.53□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 SEG2YKL105C 3399 nt4.53□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 ADP1YCR011C 3150 nt4.53□□□□□ -1.68
TMA46Q12000 AVT5YBL089W 1380 nt4.53□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 SIN4YNL236W 2925 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 MNT4YNR059W 1743 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 SWI3YJL176C 2478 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 CTT1YGR088W 1689 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 YOL019WYOL019W 1656 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 VAC7YNL054W 3498 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 snR68snR68 136 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 FAD1YDL045C 921 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 RPS18AYDR450W 441 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 IRC19YLL033W 693 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 SDO1YLR022C 753 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 IDP2YLR174W 1239 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 YKE2YLR200W 345 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 YPR136CYPR136C 513 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 NUP2YLR335W 2163 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 PDR5YOR153W 4536 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 YOL153CYOL153C 1746 nt4.52□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 OLE1YGL055W 1533 nt4.51□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 CBF5YLR175W 1452 nt4.51□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 SEC2YNL272C 2280 nt4.51□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 KIC1YHR102W 3243 nt4.51□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 RRF1YHR038W 693 nt4.51□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 YIR020CYIR020C 303 nt4.51□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 HRI1YLR301W 735 nt4.51□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 YNL058CYNL058C 951 nt4.51□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 FEX1YOR390W 1128 nt4.51□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 FEX2YPL279C 1128 nt4.51□□□□□ -1.69
TMA46Q12000 OM14YBR230C 405 nt4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.8 ms