Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMOD3Q0VAK6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms