Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LTBQ06643 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LTBQ06643 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LTBQ06643 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LTBQ06643 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LTBQ06643 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LTBQ06643 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms