Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 SOG2YOR353C 2376 nt5.26□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 PRS5YOL061W 1491 nt5.26□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 SEC59YMR013C 1560 nt5.25□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 PEX29YDR479C 1665 nt5.25□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YGR176WYGR176W 348 nt5.25□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YJR038CYJR038C 363 nt5.25□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 ERG3YLR056W 1098 nt5.25□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YOR331CYOR331C 558 nt5.25□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 TOG1YER184C 2385 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 CUE2YKL090W 1332 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 BUD14YAR014C 2130 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 KIP2YPL155C 2121 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YFL034WYFL034W 3222 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 HRK1YOR267C 2280 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 AAD3YCR107W 1092 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YDR417CYDR417C 372 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 PMI40YER003C 1290 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YGR073CYGR073C 372 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 PDX1YGR193C 1233 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 CRG1YHR209W 876 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 RDN58-1RDN58-1 158 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 RDN58-2RDN58-2 158 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 RIM9YMR063W 720 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 SCW10YMR305C 1170 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 NRM1YNR009W 750 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YPR096CYPR096C 303 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YBR209WYBR209W 318 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 SHG1YBR258C 429 nt5.24□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 AYT1YLL063C 1425 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 UBP10YNL186W 2379 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 GDB1YPR184W 4611 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 RIM15YFL033C 5313 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 ARP2YDL029W 1176 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 SCW4YGR279C 1161 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 COX8YLR395C 237 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YNL276CYNL276C 396 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 DAL82YNL314W 768 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 DAK1YML070W 1755 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 SSY5YJL156C 2100 nt5.23□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 MRPL11YDL202W 750 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 NHP2YDL208W 471 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 RRP45YDR280W 918 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YDR413CYDR413C 576 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 GCN4YEL009C 846 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YEL057CYEL057C 702 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YHI9YHR029C 885 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YAR029WYAR029W 225 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 ADI1YMR009W 540 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 JLP2YMR132C 627 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YNL184CYNL184C 327 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 NSL1YPL233W 651 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 YAR1YPL239W 603 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 GLT1YDL171C 6438 nt5.22□□□□□ -1.57
HDA3Q06623 snR59snR59 78 nt5.21□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YFL064CYFL064C 525 nt5.21□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YGR025WYGR025W 303 nt5.21□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 DFG10YIL049W 762 nt5.21□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 ECM4YKR076W 1113 nt5.21□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 CMD1YBR109C 444 nt5.21□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YMR221CYMR221C 1515 nt5.21□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 HRD1YOL013C 1656 nt5.21□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YOR1YGR281W 4434 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 NRD1YNL251C 1728 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 SHE4YOR035C 2370 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 SWT1YOR166C 1377 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YER097WYER097W 330 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 RGI2YIL057C 495 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YKL069WYKL069W 543 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 RPS1BYML063W 768 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 BET5YML077W 480 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 OST2YOR103C 393 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 ENV9YOR246C 993 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YBR032WYBR032W 303 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YCL012CYCL012C 405 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 HIS4YCL030C 2400 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 CTR86YCR054C 1692 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 SAP155YFR040W 3009 nt5.2□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 PER1YCR044C 1074 nt5.19□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 MRPL38YKL170W 417 nt5.19□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 NOP15YNL110C 663 nt5.19□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 CBC2YPL178W 627 nt5.19□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 SMP3YOR149C 1551 nt5.19□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 SYG1YIL047C 2709 nt5.19□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 PHO87YCR037C 2772 nt5.19□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 JIP5YPR169W 1479 nt5.19□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YOR022CYOR022C 2148 nt5.18□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 BUD6YLR319C 2367 nt5.18□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 MLC1YGL106W 450 nt5.18□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt5.18□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 YOR121CYOR121C 306 nt5.18□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 AFT2YPL202C 1251 nt5.18□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 IRC16YPR038W 360 nt5.18□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 FRE1YLR214W 2061 nt5.18□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 ECM32YER176W 3366 nt5.18□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 CHA4YLR098C 1947 nt5.17□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 FMP25YLR077W 1752 nt5.17□□□□□ -1.58
HDA3Q06623 PHO84YML123C 1764 nt5.17□□□□□ -1.58
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