Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 CWC22YGR278W 1734 nt2.46□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 GIN4YDR507C 3429 nt2.46□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YDL241WYDL241W 372 nt2.46□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 TGL2YDR058C 981 nt2.46□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MIC27YNL100W 705 nt2.46□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 INO4YOL108C 456 nt2.46□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 ATG29YPL166W 642 nt2.46□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YPR136CYPR136C 513 nt2.46□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 NFT1YKR103W 3657 nt2.46□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 SLP1YOR154W 1764 nt2.46□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 IKI3YLR384C 4050 nt2.46□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 BNR1YIL159W 4128 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 DSS1YMR287C 2910 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 AEP2YMR282C 1743 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 ICR1ICR1 3199 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 PEX6YNL329C 3093 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 RDI1YDL135C 609 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 DDI2YFL061W 678 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 GCD14YJL125C 1152 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YJR056CYJR056C 711 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YLR365WYLR365W 333 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MPP6YNR024W 561 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YNR068CYNR068C 819 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MPD2YOL088C 834 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 TCB2YNL087W 3537 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 TRM12YML005W 1389 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YOR365CYOR365C 2112 nt2.45□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 SAD1YFR005C 1347 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YDR290WYDR290W 330 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 HYP2YEL034W 474 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 GPP2YER062C 753 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YIR014WYIR014W 729 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MRPL49YJL096W 486 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 DID4YKL002W 699 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 PBA1YLR199C 831 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YLR339CYLR339C 552 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 CAF20YOR276W 486 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 SUR1YPL057C 1149 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 HRD1YOL013C 1656 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 CTM1YHR109W 1758 nt2.44□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 DBP5YOR046C 1449 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YDR222WYDR222W 1248 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 TAM41YGR046W 1158 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YGR160WYGR160W 612 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MRPL6YHR147C 645 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YML037CYML037C 1023 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 SPO20YMR017W 1194 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MRPL33YMR286W 261 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 TEX1YNL253W 1269 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 GPI2YPL076W 843 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 ACM1YPL267W 630 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YPR053CYPR053C 456 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 DSF2YBR007C 2211 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MSS4YDR208W 2340 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 PLM2YDR501W 1566 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 ARP8YOR141C 2646 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MTL1YGR023W 1656 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 TAF2YCR042C 4224 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 GEA1YJR031C 4227 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 DBP10YDL031W 2988 nt2.43□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 DSE4YNR067C 3354 nt2.42□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YDR340WYDR340W 303 nt2.42□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 IZH1YDR492W 951 nt2.42□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 PEX14YGL153W 1026 nt2.42□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 POP6YGR030C 477 nt2.42□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 SIC1YLR079W 855 nt2.42□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.42□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YBL096CYBL096C 309 nt2.42□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 SPF1YEL031W 3648 nt2.42□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.42□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 SIN4YNL236W 2925 nt2.41□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 PBI1YPL272C 1554 nt2.41□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.41□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 CGR1YGL029W 363 nt2.41□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 SOL3YHR163W 750 nt2.41□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt2.41□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 RSM26YJR101W 801 nt2.41□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MST28YAR033W 705 nt2.41□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YLR311CYLR311C 348 nt2.41□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 RIM9YMR063W 720 nt2.41□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.41□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 YPL150WYPL150W 2706 nt2.4□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MON1YGL124C 1935 nt2.4□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MMS1YPR164W 4224 nt2.4□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 MLH1YMR167W 2310 nt2.4□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 STE24YJR117W 1362 nt2.4□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 NUF2YOL069W 1356 nt2.4□□□□□ -2.02
NEJ1Q06148 CLN2YPL256C 1638 nt2.4□□□□□ -2.03
NEJ1Q06148 YDR355CYDR355C 303 nt2.4□□□□□ -2.03
NEJ1Q06148 NKP1YDR383C 717 nt2.4□□□□□ -2.03
NEJ1Q06148 HMF1YER057C 390 nt2.4□□□□□ -2.03
NEJ1Q06148 EBP2YKL172W 1284 nt2.4□□□□□ -2.03
NEJ1Q06148 TFA2YKR062W 987 nt2.4□□□□□ -2.03
NEJ1Q06148 APC9YLR102C 798 nt2.4□□□□□ -2.03
NEJ1Q06148 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.4□□□□□ -2.03
NEJ1Q06148 YMR310CYMR310C 954 nt2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.4 ms