Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
ATP7AQ04656 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
ATP7AQ04656 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ATP7AQ04656 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms