Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	FMP41	YNL168C	780 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	SSU72	YNL222W	621 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	DCP1	YOL149W	696 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	TAF3	YPL011C	1062 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	SEC27	YGL137W	2670 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	SIN3	YOL004W	4611 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	BCH1	YMR237W	2175 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	DSE1	YER124C	1722 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	ORC1	YML065W	2745 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	SMT3	YDR510W	306 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	RPL23B	YER117W	414 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	MPS2	YGL075C	1164 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	ANB1	YJR047C	474 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	NEJ1	YLR265C	1029 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YLR285C-A	YLR285C-A	171 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YBL028C	YBL028C	321 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YNR062C	YNR062C	984 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	BUB1	YGR188C	3066 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	AUS1	YOR011W	4185 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	TLC1	TLC1	1301 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	PCI8	YIL071C	1335 nt		3.62	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YEL075C	YEL075C	369 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	UFE1	YOR075W	1041 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	CTP1	YBR291C	900 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	RRP5	YMR229C	5190 nt		3.61	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	SPA2	YLL021W	4401 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	RTG3	YBL103C	1461 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	ARF1	YDL192W	546 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YMR099C	YMR099C	894 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	RPL13B	YMR142C	600 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YOL162W	YOL162W	648 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	GRX7	YBR014C	612 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	PEX34	YCL056C	435 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	SLY41	YOR307C	1362 nt		3.6	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	KAP95	YLR347C	2586 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	NAB6	YML117W	3405 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	RPS23A	YGR118W	438 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YIR021W-A	YIR021W-A	213 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	BET5	YML077W	480 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	PEX15	YOL044W	1152 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	TYE7	YOR344C	876 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YPR053C	YPR053C	456 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	RPS23B	YPR132W	438 nt		3.59	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	CIN8	YEL061C	3003 nt		3.59	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	GCD2	YGR083C	1956 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	FRE8	YLR047C	2061 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	FAP7	YDL166C	594 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	LIF1	YGL090W	1266 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	SCM4	YGR049W	564 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	RGI2	YIL057C	495 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	GPI14	YJR013W	1212 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YOR387C	YOR387C	621 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	snR44	snR44	211 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	SEC15	YGL233W	2733 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	MAK11	YKL021C	1407 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	CIN1	YOR349W	3045 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	CDC5	YMR001C	2118 nt		3.58	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YDR034C-C	YDR034C-C	1317 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	VBA4	YDR119W	2307 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	PEX10	YDR265W	1014 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	PIB1	YDR313C	861 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YFL065C	YFL065C	309 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YFR010W-A	YFR010W-A	189 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	ENP2	YGR145W	2124 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YJR037W	YJR037W	384 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YLR410W-A	YLR410W-A	1317 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YNL319W	YNL319W	441 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YOR238W	YOR238W	912 nt		3.57	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	ROG1	YGL144C	2058 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YPS6	YIR039C	1614 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YGL117W	YGL117W	798 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YNL184C	YNL184C	327 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	VAM10	YOR068C	345 nt		3.56	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	NDC80	YIL144W	2076 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YPL216W	YPL216W	3309 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	RTT109	YLL002W	1311 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	PET100	YDR079W	336 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	VFA1	YER128W	612 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YGR111W	YGR111W	1203 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YGR126W	YGR126W	693 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YIL054W	YIL054W	318 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	CCE1	YKL011C	1062 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	MRP8	YKL142W	660 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	REG1	YDR028C	3045 nt		3.55	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	DNA2	YHR164C	4569 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YDL157C	YDL157C	357 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YEL010W	YEL010W	351 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	LSM4	YER112W	564 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	RPL30	YGL030W	318 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YGR039W	YGR039W	312 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	CUP1-1	YHR053C	186 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	CUP1-2	YHR055C	186 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YJR020W	YJR020W	333 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	SMA2	YML066C	1110 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YOR203W	YOR203W	354 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	PPT2	YPL148C	522 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	YDL180W	YDL180W	1644 nt		3.54	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	FLO9	YAL063C	3969 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	MSB2	YGR014W	3921 nt		3.53	□□□□□ -1.84
SYF1	Q04048	NSP1	YJL041W	2472 nt		3.53	□□□□□ -1.84

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.3 ms