Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SPTBN1Q01082 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPTBN1Q01082 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms