Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDM2Q00987 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDM2Q00987 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms