Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK3Q00526 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK3Q00526 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms