Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDLBPQ00341 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDLBPQ00341 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms