Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PITPNAQ00169 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms