Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERV-K104P61576 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERV-K104P61576 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERV-K104P61576 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERV-K104P61576 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERV-K104P61576 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HERV-K104P61576 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HERV-K104P61576 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.7 ms