Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DEFA3P59666 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms