Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NME5P56597 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NME5P56597 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NME5P56597 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME5P56597 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME5P56597 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME5P56597 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME5P56597 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME5P56597 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME5P56597 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME5P56597 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
NME5P56597 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NME5P56597 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME5P56597 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME5P56597 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME5P56597 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME5P56597 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME5P56597 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME5P56597 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME5P56597 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NME5P56597 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NME5P56597 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME5P56597 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME5P56597 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NME5P56597 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NME5P56597 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME5P56597 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NME5P56597 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NME5P56597 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NME5P56597 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NME5P56597 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms