Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AIF1P55008 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AIF1P55008 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AIF1P55008 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AIF1P55008 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AIF1P55008 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AIF1P55008 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AIF1P55008 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AIF1P55008 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AIF1P55008 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AIF1P55008 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AIF1P55008 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AIF1P55008 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AIF1P55008 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AIF1P55008 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AIF1P55008 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AIF1P55008 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AIF1P55008 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AIF1P55008 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AIF1P55008 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AIF1P55008 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AIF1P55008 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms