Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CACNB3P54284 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CACNB3P54284 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms