Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YBR300C	YBR300C	498 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	YDL199C	YDL199C	2064 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	SAG1	YJR004C	1953 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	TGL3	YMR313C	1929 nt		3.31	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	NDT80	YHR124W	1884 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	YGL176C	YGL176C	1665 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	KAP104	YBR017C	2757 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	RRP42	YDL111C	798 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	DPP1	YDR284C	870 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	IES6	YEL044W	501 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	GCD2	YGR083C	1956 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	UTP5	YDR398W	1932 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	NUP60	YAR002W	1620 nt		3.3	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	SSL1	YLR005W	1386 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	YDR491C	YDR491C	492 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	YGR161W-C	YGR161W-C	279 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	YIR014W	YIR014W	729 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	snR11	snR11	258 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	BUD21	YOR078W	645 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	CUP9	YPL177C	921 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	CCT7	YJL111W	1653 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	OAF3	YKR064W	2592 nt		3.29	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	ATG26	YLR189C	3597 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	RAD2	YGR258C	3096 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	SLY41	YOR307C	1362 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	DRS2	YAL026C	4068 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	DYN2	YDR424C	279 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	YFL012W	YFL012W	447 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	BTN2	YGR142W	1233 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	YHR097C	YHR097C	1101 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	YJL156W-A	YJL156W-A	222 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	ERG20	YJL167W	1059 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	BUR2	YLR226W	1188 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	PKP2	YGL059W	1476 nt		3.28	□□□□□ -1.88
DSL1	P53847	AEP2	YMR282C	1743 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YML096W	YML096W	1578 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	CHK1	YBR274W	1584 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	ECM11	YDR446W	909 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	CNN1	YFR046C	1086 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	PET54	YGR222W	882 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YLL037W	YLL037W	381 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	WHI3	YNL197C	1986 nt		3.27	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	COP1	YDL145C	3606 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	FRE2	YKL220C	2136 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	TGL2	YDR058C	981 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	BMH2	YDR099W	822 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	LRS4	YDR439W	1044 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	TAM41	YGR046W	1158 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	SPO11	YHL022C	1197 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	IKI1	YHR187W	930 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YOL107W	YOL107W	1029 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	RIB4	YOL143C	510 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	ATP20	YPR020W	348 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	RPA135	YPR010C	3612 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	RSN1	YMR266W	2862 nt		3.26	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YDR261W-A	YDR261W-A	1317 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YDL071C	YDL071C	375 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	RPL13A	YDL082W	600 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	RPS0A	YGR214W	759 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	THP2	YHR167W	786 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YMR087W	YMR087W	855 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	TPM1	YNL079C	600 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	MIC27	YNL100W	705 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	CIN2	YPL241C	807 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	SRC1	YML034W	2505 nt		3.25	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	MIP6	YHR015W	1980 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	RGI2	YIL057C	495 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	MDV1	YJL112W	2145 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	PCD1	YLR151C	1023 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	PBA1	YLR199C	831 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	RPS30A	YLR287C-A	192 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YBL055C	YBL055C	1257 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	ALG8	YOR067C	1734 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	EXO70	YJL085W	1872 nt		3.24	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	DUF1	YOL087C	3351 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YFR010W-A	YFR010W-A	189 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	CGR1	YGL029W	363 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	GTR2	YGR163W	1026 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	VPS53	YJL029C	2469 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	URA5	YML106W	681 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	PIN4	YBL051C	2007 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	INN1	YNL152W	1230 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	RUF5-1	RUF5-1	710 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	RUF5-2	RUF5-2	710 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YPL135C-A	YPL135C-A	174 nt		3.23	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	MOT1	YPL082C	5604 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	GPM2	YDL021W	936 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	CLB3	YDL155W	1284 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	TVP15	YDR100W	432 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YPR1	YDR368W	939 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	RMT2	YDR465C	1239 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YHR182C-A	YHR182C-A	474 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	CTK2	YJL006C	972 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	YLR230W	YLR230W	306 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	RFC5	YBR087W	1065 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	ARG2	YJL071W	1725 nt		3.22	□□□□□ -1.89
DSL1	P53847	snR83	snR83	306 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	VMA8	YEL051W	771 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	SDP1	YIL113W	630 nt		3.21	□□□□□ -1.9
DSL1	P53847	YBL028C	YBL028C	321 nt		3.21	□□□□□ -1.9

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