Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AP3M2P53677 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AP3M2P53677 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms