Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ARFIP1P53367 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ARFIP1P53367 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms