Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DAP3P51398 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DAP3P51398 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DAP3P51398 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DAP3P51398 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DAP3P51398 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DAP3P51398 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DAP3P51398 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DAP3P51398 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DAP3P51398 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DAP3P51398 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DAP3P51398 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DAP3P51398 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DAP3P51398 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DAP3P51398 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DAP3P51398 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DAP3P51398 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DAP3P51398 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms