Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPFP49454 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CENPFP49454 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CENPFP49454 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CENPFP49454 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CENPFP49454 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPFP49454 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPFP49454 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPFP49454 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPFP49454 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPFP49454 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPFP49454 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPFP49454 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CENPFP49454 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CENPFP49454 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPFP49454 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPFP49454 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CENPFP49454 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPFP49454 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPFP49454 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPFP49454 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPFP49454 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPFP49454 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPFP49454 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPFP49454 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPFP49454 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPFP49454 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CENPFP49454 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPFP49454 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPFP49454 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPFP49454 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPFP49454 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPFP49454 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPFP49454 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPFP49454 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPFP49454 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPFP49454 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CENPFP49454 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CENPFP49454 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms