Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNTAP49354 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNTAP49354 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNTAP49354 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNTAP49354 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNTAP49354 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNTAP49354 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNTAP49354 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNTAP49354 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNTAP49354 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNTAP49354 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNTAP49354 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FNTAP49354 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FNTAP49354 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNTAP49354 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNTAP49354 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNTAP49354 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNTAP49354 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNTAP49354 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNTAP49354 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNTAP49354 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNTAP49354 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNTAP49354 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNTAP49354 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNTAP49354 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNTAP49354 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNTAP49354 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNTAP49354 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNTAP49354 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNTAP49354 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNTAP49354 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNTAP49354 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTAP49354 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTAP49354 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTAP49354 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTAP49354 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTAP49354 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTAP49354 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNTAP49354 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTAP49354 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTAP49354 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTAP49354 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTAP49354 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTAP49354 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FNTAP49354 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FNTAP49354 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms