Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRB2P47870 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRB2P47870 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms