Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GATA4P43694 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GATA4P43694 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GATA4P43694 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GATA4P43694 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GATA4P43694 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GATA4P43694 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATA4P43694 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATA4P43694 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATA4P43694 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATA4P43694 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATA4P43694 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATA4P43694 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATA4P43694 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GATA4P43694 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms