Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MAGEA3P43357 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MAGEA3P43357 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MAGEA3P43357 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAGEA3P43357 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAGEA3P43357 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA3P43357 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA3P43357 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA3P43357 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA3P43357 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA3P43357 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA3P43357 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA3P43357 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MAGEA3P43357 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MAGEA3P43357 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAGEA3P43357 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms