Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPD2P43304 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPD2P43304 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPD2P43304 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPD2P43304 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPD2P43304 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPD2P43304 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPD2P43304 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPD2P43304 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPD2P43304 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPD2P43304 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPD2P43304 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPD2P43304 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPD2P43304 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPD2P43304 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPD2P43304 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPD2P43304 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPD2P43304 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPD2P43304 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPD2P43304 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPD2P43304 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPD2P43304 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPD2P43304 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPD2P43304 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPD2P43304 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPD2P43304 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPD2P43304 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPD2P43304 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPD2P43304 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPD2P43304 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms