Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DCCP43146 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DCCP43146 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DCCP43146 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DCCP43146 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DCCP43146 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DCCP43146 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DCCP43146 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DCCP43146 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DCCP43146 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DCCP43146 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DCCP43146 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DCCP43146 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DCCP43146 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DCCP43146 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DCCP43146 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DCCP43146 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DCCP43146 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DCCP43146 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DCCP43146 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
DCCP43146 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DCCP43146 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DCCP43146 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DCCP43146 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DCCP43146 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DCCP43146 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DCCP43146 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DCCP43146 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DCCP43146 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DCCP43146 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
DCCP43146 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DCCP43146 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DCCP43146 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DCCP43146 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DCCP43146 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DCCP43146 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DCCP43146 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DCCP43146 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DCCP43146 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DCCP43146 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DCCP43146 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DCCP43146 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCCP43146 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCCP43146 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCCP43146 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCCP43146 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCCP43146 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCCP43146 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCCP43146 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCCP43146 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DCCP43146 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms