Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PBX2P40425 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX2P40425 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX2P40425 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX2P40425 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX2P40425 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX2P40425 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX2P40425 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PBX2P40425 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX2P40425 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PBX2P40425 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PBX2P40425 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX2P40425 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX2P40425 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX2P40425 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX2P40425 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX2P40425 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX2P40425 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms