Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
THPOP40225 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
THPOP40225 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
THPOP40225 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
THPOP40225 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
THPOP40225 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
THPOP40225 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
THPOP40225 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms