Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRCA1P38398 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRCA1P38398 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms