Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7BP35670 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7BP35670 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7BP35670 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7BP35670 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7BP35670 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7BP35670 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP7BP35670 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP7BP35670 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP7BP35670 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP7BP35670 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP7BP35670 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP7BP35670 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP7BP35670 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms