Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
USP6P35125 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP6P35125 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP6P35125 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP6P35125 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP6P35125 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP6P35125 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP6P35125 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
USP6P35125 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP6P35125 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP6P35125 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP6P35125 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
USP6P35125 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP6P35125 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP6P35125 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP6P35125 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP6P35125 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP6P35125 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP6P35125 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP6P35125 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP6P35125 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP6P35125 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP6P35125 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
USP6P35125 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP6P35125 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP6P35125 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP6P35125 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP6P35125 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
USP6P35125 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP6P35125 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP6P35125 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP6P35125 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP6P35125 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP6P35125 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP6P35125 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
USP6P35125 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP6P35125 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP6P35125 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP6P35125 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP6P35125 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP6P35125 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP6P35125 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP6P35125 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP6P35125 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
USP6P35125 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP6P35125 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP6P35125 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
USP6P35125 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP6P35125 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP6P35125 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP6P35125 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP6P35125 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP6P35125 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP6P35125 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
USP6P35125 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
USP6P35125 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP6P35125 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP6P35125 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP6P35125 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
USP6P35125 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP6P35125 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP6P35125 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP6P35125 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP6P35125 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP6P35125 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
USP6P35125 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
USP6P35125 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP6P35125 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
USP6P35125 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP6P35125 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
USP6P35125 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms