Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GBP1P32455 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GBP1P32455 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GBP1P32455 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GBP1P32455 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GBP1P32455 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GBP1P32455 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBP1P32455 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP1P32455 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP1P32455 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP1P32455 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP1P32455 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP1P32455 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP1P32455 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP1P32455 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP1P32455 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP1P32455 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP1P32455 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBP1P32455 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms