Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXD10P28358 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXD10P28358 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXD10P28358 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms