Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM3P25205 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MCM3P25205 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MCM3P25205 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MCM3P25205 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MCM3P25205 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MCM3P25205 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MCM3P25205 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MCM3P25205 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MCM3P25205 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms