Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRGP23470 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRGP23470 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRGP23470 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
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