Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRBP23467 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPRBP23467 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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