Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FGFR3P22607 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FGFR3P22607 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms