Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYT1P21579 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYT1P21579 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYT1P21579 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYT1P21579 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYT1P21579 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYT1P21579 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYT1P21579 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYT1P21579 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYT1P21579 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYT1P21579 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYT1P21579 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYT1P21579 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms