Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDK11BP21127 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDK11BP21127 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms